Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2AFJQ9BTM1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2AFJQ9BTM1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms