Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms