Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA3CQ99985 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3CQ99985 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms