Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD9AQ99638 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD9AQ99638 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD9AQ99638 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD9AQ99638 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD9AQ99638 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD9AQ99638 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD9AQ99638 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD9AQ99638 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD9AQ99638 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD9AQ99638 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD9AQ99638 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD9AQ99638 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD9AQ99638 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD9AQ99638 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms