Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf72Q96LT7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms