Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms