Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms