Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRAT1Q92837 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms