Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms