Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB73

NDNF, Protein NDNF, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNFQ8TB73 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDNFQ8TB73 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms