Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AGBL3Q8NEM8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AGBL3Q8NEM8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AGBL3Q8NEM8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AGBL3Q8NEM8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AGBL3Q8NEM8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AGBL3Q8NEM8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AGBL3Q8NEM8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AGBL3Q8NEM8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AGBL3Q8NEM8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AGBL3Q8NEM8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AGBL3Q8NEM8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AGBL3Q8NEM8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AGBL3Q8NEM8 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms