Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CARMIL3Q8ND23 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms