Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms