Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP4Q8N2S1 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms