Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms