Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms