Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM164Q5U3C3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms