Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LACTB2Q53H82 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms