Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms