Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC27Q2M243 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms