Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RRN3P1Q2M238 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RRN3P1Q2M238 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RRN3P1Q2M238 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RRN3P1Q2M238 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RRN3P1Q2M238 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RRN3P1Q2M238 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RRN3P1Q2M238 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RRN3P1Q2M238 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RRN3P1Q2M238 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RRN3P1Q2M238 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RRN3P1Q2M238 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RRN3P1Q2M238 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RRN3P1Q2M238 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RRN3P1Q2M238 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RRN3P1Q2M238 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RRN3P1Q2M238 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RRN3P1Q2M238 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RRN3P1Q2M238 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RRN3P1Q2M238 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RRN3P1Q2M238 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RRN3P1Q2M238 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RRN3P1Q2M238 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RRN3P1Q2M238 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RRN3P1Q2M238 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
RRN3P1Q2M238 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms