Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPROQ16827 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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PTPROQ16827 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPROQ16827 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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