Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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EXT1Q16394 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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EXT1Q16394 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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EXT1Q16394 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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EXT1Q16394 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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EXT1Q16394 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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EXT1Q16394 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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EXT1Q16394 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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EXT1Q16394 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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