Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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