Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIP10Q15642 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms