Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TLR1Q15399 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TLR1Q15399 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms