Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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