Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SCGB2A2Q13296 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms