Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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