Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN2AQ12879 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN2AQ12879 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
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