Protein–RNA interactions for Protein: Q0GE19

SLC10A7, Sodium/bile acid cotransporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A7Q0GE19 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC10A7Q0GE19 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC10A7Q0GE19 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC10A7Q0GE19 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC10A7Q0GE19 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC10A7Q0GE19 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC10A7Q0GE19 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC10A7Q0GE19 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC10A7Q0GE19 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC10A7Q0GE19 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC10A7Q0GE19 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC10A7Q0GE19 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC10A7Q0GE19 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC10A7Q0GE19 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC10A7Q0GE19 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC10A7Q0GE19 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC10A7Q0GE19 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC10A7Q0GE19 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC10A7Q0GE19 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms