Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms