Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIBQ01892 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms