Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms