Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL20P78556 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL20P78556 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL20P78556 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL20P78556 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL20P78556 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL20P78556 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CCL20P78556 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CCL20P78556 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL20P78556 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL20P78556 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CCL20P78556 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CCL20P78556 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CCL20P78556 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL20P78556 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CCL20P78556 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CCL20P78556 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL20P78556 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CCL20P78556 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCL20P78556 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CCL20P78556 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL20P78556 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCL20P78556 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CCL20P78556 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CCL20P78556 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CCL20P78556 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CCL20P78556 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CCL20P78556 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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CCL20P78556 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL20P78556 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL20P78556 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL20P78556 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL20P78556 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL20P78556 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL20P78556 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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