Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms