Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CABP4P57796 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CABP4P57796 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CABP4P57796 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CABP4P57796 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CABP4P57796 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CABP4P57796 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CABP4P57796 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CABP4P57796 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CABP4P57796 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CABP4P57796 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CABP4P57796 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CABP4P57796 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CABP4P57796 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CABP4P57796 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CABP4P57796 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CABP4P57796 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CABP4P57796 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CABP4P57796 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CABP4P57796 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CABP4P57796 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CABP4P57796 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CABP4P57796 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CABP4P57796 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CABP4P57796 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CABP4P57796 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CABP4P57796 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CABP4P57796 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CABP4P57796 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CABP4P57796 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CABP4P57796 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CABP4P57796 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CABP4P57796 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CABP4P57796 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CABP4P57796 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CABP4P57796 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CABP4P57796 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CABP4P57796 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CABP4P57796 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CABP4P57796 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CABP4P57796 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CABP4P57796 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CABP4P57796 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CABP4P57796 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CABP4P57796 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CABP4P57796 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CABP4P57796 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CABP4P57796 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CABP4P57796 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CABP4P57796 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CABP4P57796 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CABP4P57796 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CABP4P57796 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CABP4P57796 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CABP4P57796 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CABP4P57796 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CABP4P57796 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CABP4P57796 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CABP4P57796 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CABP4P57796 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CABP4P57796 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CABP4P57796 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CABP4P57796 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CABP4P57796 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CABP4P57796 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CABP4P57796 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CABP4P57796 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CABP4P57796 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CABP4P57796 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CABP4P57796 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CABP4P57796 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CABP4P57796 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CABP4P57796 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CABP4P57796 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CABP4P57796 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CABP4P57796 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CABP4P57796 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CABP4P57796 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CABP4P57796 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CABP4P57796 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CABP4P57796 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CABP4P57796 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CABP4P57796 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CABP4P57796 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CABP4P57796 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CABP4P57796 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CABP4P57796 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CABP4P57796 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CABP4P57796 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CABP4P57796 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CABP4P57796 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CABP4P57796 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CABP4P57796 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CABP4P57796 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CABP4P57796 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CABP4P57796 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CABP4P57796 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CABP4P57796 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CABP4P57796 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CABP4P57796 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms