Protein–RNA interactions for Protein: P55957

BID, BH3-interacting domain death agonist, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIDP55957 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BIDP55957 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BIDP55957 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BIDP55957 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BIDP55957 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BIDP55957 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BIDP55957 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BIDP55957 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BIDP55957 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BIDP55957 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BIDP55957 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BIDP55957 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BIDP55957 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BIDP55957 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BIDP55957 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BIDP55957 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BIDP55957 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BIDP55957 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BIDP55957 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BIDP55957 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BIDP55957 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BIDP55957 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BIDP55957 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BIDP55957 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BIDP55957 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BIDP55957 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BIDP55957 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BIDP55957 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BIDP55957 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BIDP55957 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BIDP55957 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BIDP55957 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BIDP55957 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BIDP55957 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BIDP55957 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BIDP55957 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BIDP55957 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BIDP55957 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BIDP55957 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BIDP55957 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BIDP55957 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BIDP55957 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BIDP55957 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BIDP55957 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BIDP55957 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BIDP55957 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BIDP55957 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BIDP55957 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BIDP55957 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BIDP55957 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BIDP55957 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BIDP55957 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BIDP55957 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BIDP55957 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BIDP55957 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BIDP55957 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BIDP55957 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BIDP55957 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BIDP55957 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BIDP55957 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BIDP55957 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms