Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNBP48739 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNBP48739 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms