Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AFMP43652 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AFMP43652 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AFMP43652 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFMP43652 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFMP43652 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFMP43652 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFMP43652 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFMP43652 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFMP43652 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFMP43652 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFMP43652 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
AFMP43652 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFMP43652 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFMP43652 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
AFMP43652 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFMP43652 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFMP43652 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
AFMP43652 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFMP43652 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFMP43652 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFMP43652 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFMP43652 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFMP43652 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFMP43652 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AFMP43652 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
AFMP43652 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AFMP43652 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AFMP43652 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AFMP43652 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AFMP43652 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AFMP43652 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AFMP43652 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AFMP43652 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AFMP43652 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
AFMP43652 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
AFMP43652 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AFMP43652 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AFMP43652 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AFMP43652 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AFMP43652 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AFMP43652 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AFMP43652 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AFMP43652 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AFMP43652 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AFMP43652 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AFMP43652 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AFMP43652 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AFMP43652 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AFMP43652 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AFMP43652 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AFMP43652 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AFMP43652 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AFMP43652 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AFMP43652 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AFMP43652 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AFMP43652 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms