Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC1A3P43003 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms