Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZEB1P37275 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms