Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms