Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms