Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms