Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX2P28328 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PEX2P28328 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PEX2P28328 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms