Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms