Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PLNP26678 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms