Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CXCR1P25024 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCR1P25024 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms