Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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